identification et caractérisation fonctionnelle des arn longs non-codant dans les leucémies aigües mégakaryoblastiques

la mégacaryopoïèse est le processus qui génère les mégacaryocytes à partir de cellules souches hématopoïétiques. les mégacaryocytes sont des cellules hématopoïétiques matures qui libèrent quotidiennement 1011 plaquettes sanguines, qui sont les principaux effecteurs de l'hémostase. la dérégulation de ce processus peut mener à la transformation oncogénique comme dans la leucémie aiguë mégacaryoblastique (lamk). une inversion cryptique du chromosome 16 aboutit à la fusion du répresseur cbfa2t3 (ou eto2), au facteur de transcription glis2 induisant l'oncogène chimérique le plus fréquent chez les patients pédiatriques non trisomiques atteints de lamk (17%) qui confère un mauvais pronostic. ainsi, le développement de thérapies ciblées contre cette maladie est d'une importance majeure. la plupart des efforts visant à comprendre la transformation et la progression des lamk se sont concentrés sur la partie codante du génome, qui chez l'homme représente moins de 2% de tout le matériel génétique. cependant, il est aujourd’hui connu qu'une grande partie du génome non codant est transcrit en arn. notamment, les arn longs non-codants (arnlnc) jouent un rôle majeur dans les processus homéostatique et la transformation cancéreuse. nos données préliminaires basées sur le séquençage de l'arn de mégacaryocytes normaux et leucémiques ont révélé la présence de nombreux arnlnc ayant des profils d'expression spécifiques. cependant, la signification fonctionnelle de ces transcrits est encore grandement inconnue. notre projet de recherche vise à caractériser fonctionnellement ces arnlnc en utilisant les méthodes de crispri, a, qui permettent de moduler leur expression dans des cellules de lamk in vitro et in vivo et caractériser en particulier leur impact sur la régulation de la transcription et l'organisation de la chromatine. ces résultats permettront de mieux comprendre les mécanismes moléculaires responsables des lamk et pourraient ouvrir la voie à de nouvelles thérapies.

megakaryopoiesis is the process that generates megakaryocytes from hematopoietic stem cells. megakaryocytes are mature hematopoietic cells that release daily 1011 blood platelets, which are the major effectors in hemostasis. dysregulation of this process can lead to oncogenic transformation like in acute megakaryoblastic leukemia (amkl). a cryptic inversion of chromosome 16 results in the fusion of cbfa2t3 (or eto2), a member of the eto family of nuclear co-repressors, to glis2, a member of the gli family of transcription factors that is the most frequent chimeric oncogene identified to date in pediatric non down syndrome amkl patients (17%), confers a poor prognosis and lack efficient treatments. thus, development of targeted therapies against this disease is of major significance. to date most efforts in understanding amkl transformation and progression have focused on the protein-coding genome, which in humans represents less than 2% of all our genetic material. despite this fact, it is now known that a large proportion of the non-coding genome is transcribed into rna. recently has it become clear that long non-coding rnas (lncrna) are key regulators of gene expression programs in homeostasis and cancer. our preliminary data based on rna sequencing of normal and leukemic megakaryocytes have revealed the presence of thousands of lncrna transcripts, which display temporal and lineage specific expression patterns similar to known protein-coding genes. however, the functional significance of these transcripts is still majorly unknown. our research proposal aim to functionally characterize these lncrna using tools, such as crispri, a, that can modulate their expression in amkl cells both in vitro and in vivo and particularly characterize their impact on regulation of transcription and chromatin organization. this resource will lead to a better understanding of the molecular mechanisms driving amkl and may open avenues for novel therapeutic design.